基于癌癥 Cytogenomics 芯片協(xié)會的設計

2011 年 10 月，蒙特利爾——安捷倫科技公司（紐約證交所：A）今日發(fā)布 SurePrint G3 CGH+SNP 癌癥目錄芯片，該款芯片能夠在同一實驗中檢測出癌癥組織樣本中的拷貝數(shù)和中性拷貝變異，將極大地滿足研究人員日益增長的此類需求。

安捷倫發(fā)布芯片的同時還發(fā)布了 CytoGenomics 2.0 軟件，該款軟件用于支持對遺傳學復雜的樣本，例如血液類癌癥樣本進行 CGH+SNP 分析。

這款新型芯片是基于癌癥 Cytogenomics 芯片協(xié)會的設計，連同安捷倫世界一流的 CGH+SNP 芯片與 ISCA 芯片一起，成為細胞遺傳學研究中不可或缺的重要工具。

貝勒醫(yī)學院人類分子遺傳學教授 Marilyn M. Li 說道：“癌癥遺傳學領(lǐng)域迫切需要一個兼具 CGH 和 SNP 微陣列所有優(yōu)勢的平臺。整合后的 CGH-SNP 平臺能夠檢測基因組上中性拷貝數(shù)變異，拷貝數(shù)擴增、雜合性缺失以及在單核苷酸多態(tài)性（SNP）沙漠區(qū)域的拷貝數(shù)變異。包含 SNP 探針的CGH 微陣列，能夠提高檢測低比例嵌合現(xiàn)象的準確度，還有助于測定癌癥基因組的倍體形式�；�于SNP 探針提供的等位基因信息具有極其重要意義。例如，SNP 等位基因譜有助于區(qū)分哪些是真正的高亞二倍體，哪些是亞二倍體的復制，從而深入了解疾病演化�！�

安捷倫基因組學高級營銷總監(jiān) Kathleen Shelton 談到：“多年來，我們的雙色 CGH 芯片平臺廣泛用于癌癥研究，發(fā)表的論文多達幾百篇。我們非常自豪地推出這款芯片，它融入了中性拷貝數(shù)雜合性缺失（LOH） 分析功能，能夠獲得與拷貝數(shù)數(shù)據(jù)同等準確的結(jié)果，在同款芯片上實現(xiàn)了5-Mb 的 LOH 分辨率�！�

安捷倫同時發(fā)布了 CytoGenomics 2.0 軟件，芯片用戶可免費獲得，用于對 SurePrint CGH+SNP 癌癥芯片實驗得到的數(shù)據(jù)進行分析。CytoGenomics 2.0 軟件采用新的算法，能夠分析基因組復雜的樣本（常見于拷貝數(shù)變異導致的癌癥）、腫瘤異質(zhì)性樣本、腫瘤細胞和正常細胞的混合樣本。

除了目錄芯片，安捷倫還提供 SurePrint G3 CGH+SNP 癌癥芯片簡單定制的功能。通過安捷倫 eArray 在線設計工具，用戶可在 65,000 個SNP探針以及 2800 萬個預審的 CGH 探針中隨意選擇。

這些新產(chǎn)品進一步擴充了安捷倫種類齊全的基因組解決方案大軍，包括 Bravo 自動化液體處理平臺、新一代 SureScan 芯片掃描儀、各種試劑以及生物信息學軟件。安捷倫還就世界一流的 SureSelect XT 靶向序列捕獲系統(tǒng)為進行新一代測序提供完善的樣品制備工作流程。

要了解更多信息，請訪問 www.agilent.com/genomics/cgh_snp。