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生物信息學(xué)首選語(yǔ)言--Perl語(yǔ)言零基礎(chǔ)培訓(xùn)班通知

瀏覽次數(shù):4062 發(fā)布日期:2013-8-13  來(lái)源:本站 本站原創(chuàng),轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明出處
Perl語(yǔ)言作為絕大多數(shù)生物信息學(xué)工作者首選語(yǔ)言之一。北京市計(jì)算中心生物計(jì)算事業(yè)部針對(duì)沒(méi)有任何計(jì)算機(jī)語(yǔ)言的生物學(xué)、醫(yī)學(xué)、農(nóng)學(xué)等人員,且有從事生物信息學(xué)工作相關(guān)研究工作的需要。歡迎您報(bào)名參加!
主辦單位:北京市計(jì)算中心,生物計(jì)算事業(yè)部
舉辦地:北京,北京市海淀區(qū)豐賢中路7號(hào)北科產(chǎn)業(yè)3號(hào)樓
培訓(xùn)時(shí)間2013年8月26日-29日 
報(bào)名截止:2013年 8月25日
培訓(xùn)內(nèi)容及安排: 
日期
時(shí)間
授課題目
授課內(nèi)容
第一天
09:30-10:00
生物信息學(xué)與Perl語(yǔ)言概述
概括介紹生物信息學(xué)背景與Perl語(yǔ)言的概念及特點(diǎn)
10:00-10:20
軟件安裝與運(yùn)行環(huán)境調(diào)試
Perl語(yǔ)言解釋器、編輯器安裝,Perl程序運(yùn)行測(cè)試
10:20-12:00
基本操作與基本概念
DOS、Unix命令行操作基本命令;Perl語(yǔ)言基本變量與操作符
13:30-16:00
基本變量
變量、字符串賦值、基本運(yùn)算等練習(xí)
第二天
09:30-12:00
基本語(yǔ)法結(jié)構(gòu)
判斷結(jié)構(gòu);循環(huán)結(jié)構(gòu);練習(xí)
13:30-16:00
數(shù)組及應(yīng)用
數(shù)組的概念及用法;練習(xí)
第三天
09:30-11:00
文件與文件夾操作
文件的讀入與輸入;文件夾操作;練習(xí)
11:00-12:00
二維數(shù)組與hash表及應(yīng)用
二維數(shù)組概念、關(guān)聯(lián)數(shù)組(hash表)概念及用法;練習(xí)
13:30-16:00
常用函數(shù)及子程序
常用Perl語(yǔ)言基礎(chǔ)函數(shù)學(xué)習(xí);子程序概念與應(yīng)用;練習(xí)
第四天
09:30-12:00
正則表達(dá)式及生物信息學(xué)Perl程序?qū)嵗?/DIV>
Perl特色功能正則表達(dá)式學(xué)習(xí)與應(yīng)用;生物信息學(xué)實(shí)例程序?qū)W習(xí);練習(xí)
13:30-16:00
Bioperl簡(jiǎn)介、CPAN簡(jiǎn)介、常用生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)與軟件簡(jiǎn)介
Bioperl簡(jiǎn)介與安裝;Perl第三方代碼庫(kù)CPAN簡(jiǎn)介;常用生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)簡(jiǎn)介、數(shù)據(jù)類(lèi)型與應(yīng)用;常用生物信息學(xué)軟件數(shù)據(jù)格式及軟件應(yīng)用簡(jiǎn)介
授課實(shí)例
1、生物學(xué)數(shù)據(jù)文件批量的合并、分隔、去冗余等。
2、生物信息序列數(shù)據(jù)fastq、fasta、genbank文件等格式轉(zhuǎn)換與批量自動(dòng)化處理。
3、按個(gè)性化實(shí)驗(yàn)需求,從生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)文件(如genbank、EMBL)中批量自動(dòng)化提取特定數(shù)據(jù)信息。
4、表格矩陣型數(shù)據(jù)的行列轉(zhuǎn)換、特定數(shù)據(jù)信息的自動(dòng)化過(guò)濾與數(shù)據(jù)篩選等。
5、二代測(cè)序原始數(shù)據(jù)的批量過(guò)濾處理,如barcode識(shí)別、質(zhì)量值過(guò)濾等。
6、基因、蛋白質(zhì)序列特定位點(diǎn)的識(shí)別,如起始、終止位點(diǎn)、ORF、motif、CDS等。
7、生物信息學(xué)數(shù)據(jù)序列特征提取與自動(dòng)化統(tǒng)計(jì),如GC百分含量、k-mer統(tǒng)計(jì)、基因反向互補(bǔ)轉(zhuǎn)換等。
8、生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)文件的批量自動(dòng)化下載與信息提。ㄟx學(xué))。
(此表僅供參考,授課內(nèi)容以實(shí)際授課為準(zhǔn))
培訓(xùn)特色
1、對(duì)口生物信息;    2、非嚴(yán)格語(yǔ)法,適合初學(xué);
3、功能強(qiáng)大、跨平臺(tái);4、有巨大的第三方代碼庫(kù)CPAN
報(bào)名費(fèi)用  注冊(cè)費(fèi):2800元/人(含聽(tīng)課費(fèi)、資料費(fèi)、上機(jī)費(fèi)、午餐,請(qǐng)自帶筆記本電腦以備上機(jī)實(shí)踐使用),主辦方可協(xié)助安排入住酒店,住宿費(fèi)用自理。
付費(fèi)方式現(xiàn)金、支票、銀行轉(zhuǎn)賬、銀行匯款
單位全稱(chēng):北京市計(jì)算中心      賬號(hào):0200151819100023937 
開(kāi)戶(hù)銀行:中國(guó)工商銀行股份有限公司北京永豐支行
(匯款信息里 備注上:“生物計(jì)算事業(yè)部——您的姓名”)
報(bào)名優(yōu)惠政策
1、開(kāi)課前20天報(bào)名的學(xué)員每人可減少200元;
   2、3人以上團(tuán)體報(bào)名的學(xué)員每人可減少200元;
   3、任意兩班同時(shí)報(bào)名可減少300元;
   4、4+1團(tuán)報(bào),可免費(fèi)贈(zèng)送一個(gè)名額                
   5、4種優(yōu)惠政策不能同時(shí)享受,只能享受其中一種
聯(lián)系咨詢(xún)
張利英 010-59341771 ,18618295767,QQ號(hào):2814500767,郵箱:zhangly@bcc.ac.cn
員麗麗 010-59341773, 18701529461 ,  郵箱:yuanll@bcc.ac.cn
報(bào)名回執(zhí)表:
培訓(xùn)班類(lèi)型:(可多選)
□實(shí)用生物信息學(xué)培訓(xùn)班  □論文發(fā)表所需的圖表處理實(shí)用技能
生物信息與宏基因組分析專(zhuān)題研討班    □Perl語(yǔ)言專(zhuān)題班
□實(shí)用生物信息技術(shù)及應(yīng)用(羅靜初教授主講)
姓名:
 
性別
 
民族:
 
職稱(chēng):
 
身份證號(hào)
 
工作單位:
 
住宿:
是□;否□
研究方向:
 
報(bào)名時(shí)間:
 
通訊地址:
 
郵編:
 
固定電話:
 
手機(jī)
 
E-mail:
 
報(bào)名種類(lèi):
A□           B□             (該選項(xiàng)僅報(bào)名生物信息培訓(xùn)班人員填寫(xiě))
對(duì)課程了解情況
☆☆☆☆☆
感興趣的課程:
 
信息渠道:
□中心主頁(yè) □郵件宣傳(張利英、員麗麗)□海報(bào) □單頁(yè) □銷(xiāo)售員  □丁香園  □生物論壇  □生物通郵件、主頁(yè)  □朋友推薦               
發(fā)票抬頭:
 
發(fā)票內(nèi)容:
 
住宿明細(xì)
入住時(shí)間:
離店時(shí)間:
房間類(lèi)型
□大床間
□標(biāo)準(zhǔn)間(和       合。
□拼房(與其他學(xué)員拼標(biāo)準(zhǔn)間)
備注:
 
確定報(bào)名后,請(qǐng)將回執(zhí)表發(fā)到上述聯(lián)系人郵箱里。如在兩日內(nèi)沒(méi)有收到回復(fù),請(qǐng)電話聯(lián)系確認(rèn)。


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