美國(guó)FDA多家檢測(cè)中心和研究者可接入QIAGEN數(shù)據(jù)分析系統(tǒng),使用微生物和微生物組等分析應(yīng)用。
2016年2月2日,QIAGEN宣布了多項(xiàng)新合作協(xié)議,進(jìn)一步突顯QIAGEN在微生物組和宏基因組生物信息學(xué)領(lǐng)域的主導(dǎo)地位。
QIAGEN與遺傳大數(shù)據(jù)公司CosmosID, Inc簽訂了協(xié)議,CosmosID的宏基因組平臺(tái)整合入QIAGEN CLC Genomics Workbench數(shù)據(jù)分析平臺(tái),供用戶使用。CosmosID分析平臺(tái)能夠從全基因組shotgun數(shù)據(jù)中辨別微生物群落,并分析其特征,確定相對(duì)豐度。新接入的分析平臺(tái)進(jìn)一步增強(qiáng)了QIAGEN微生物遺傳學(xué)分析能力,拓展了宏基因組學(xué)和微生物組相關(guān)應(yīng)用,使傳染病、動(dòng)物健康、農(nóng)業(yè)、環(huán)境和食品安全領(lǐng)域的研究人員能夠在常規(guī)二代測(cè)序檢測(cè)中應(yīng)用shotgun宏基因組學(xué)分析。
宏基因組學(xué)和微生物研究旨在探索微生物對(duì)環(huán)境和人體健康的影響,近年來(lái)取得快速發(fā)展。2015年底,QIAGEN收購(gòu)了MO BIO Laboratories, Inc,這是一家微生物樣本制備技術(shù)的領(lǐng)導(dǎo)企業(yè),由此更加完善了QIAGEN在微生物領(lǐng)域的解決方案。
此外,QIAGEN早前宣布的與Trigent Solutions Inc公司的合作,使得QIAGEN生物信息學(xué)解決方案能夠順利進(jìn)入美國(guó)食品藥品監(jiān)督管理局(FDA)多家檢測(cè)中心。相關(guān)產(chǎn)品包括適合傳染病研究和爆發(fā)分析的軟件,如CLC Genomics Workbench、CLC Microbial Genomics Module、CLC Genome Finishing Module,以及人類基因組相關(guān)分析軟件,如Biomedical Genomics Workbench、Ingenuity® Variant AnalysisTM和Ingenuity® Pathway Analysis。
由于之前QIAGEN與FDA的合作關(guān)系,此協(xié)議將這一長(zhǎng)期的生物信息學(xué)合作關(guān)系拓展到共7家FDA檢測(cè)中心,應(yīng)用領(lǐng)域包括人體健康和食品安全等。QIAGEN提供的產(chǎn)品和服務(wù)使FDA能夠?qū)?shù)據(jù)上傳至國(guó)家生物技術(shù)信息(NCBI)SRA生物基因序列數(shù)據(jù)庫(kù),與美國(guó)和各國(guó)際機(jī)構(gòu)共享公共健康數(shù)據(jù),以抗擊國(guó)內(nèi)國(guó)際范圍的傳染病爆發(fā)。
QIAGEN生物信息學(xué)業(yè)務(wù)高級(jí)副總裁Laura Furmanski博士表示,“我們很高興成功簽署了這些協(xié)議。我們領(lǐng)先的生物信息學(xué)解決方案能夠使更多用戶得以分析二代測(cè)序的龐大數(shù)據(jù)量,獲得切實(shí)有意義的數(shù)據(jù)解讀結(jié)果!
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