單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及生信分析培訓(xùn)班報(bào)名通知
單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)近年屢次被評(píng)為生物科研熱點(diǎn)，文獻(xiàn)發(fā)表也呈現(xiàn)迅猛增長(zhǎng)趨勢(shì)。Nature期刊最近評(píng)出2019年最值得期待的7項(xiàng)生物技術(shù)，擴(kuò)展單細(xì)胞生物學(xué)（Expand single-cell biology）位列其中之一。SBC引進(jìn)的10x Genomics Chromium™平臺(tái)，基于GemCode™微流控技術(shù)進(jìn)行單個(gè)細(xì)胞分選，可一次性獲得大量單細(xì)胞的基因表達(dá)數(shù)據(jù)，從而達(dá)到在單細(xì)胞水平進(jìn)行表達(dá)測(cè)序的目的。
為幫助科研工作者深入了解單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)，SBC茲定于2019年6月28-29日在上海生物芯片有限公司/生物芯片上海國(guó)家工程研究中心舉辦單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及生信分析培訓(xùn)班。希望通過(guò)此次培訓(xùn)讓學(xué)員全面了解單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的實(shí)驗(yàn)原理、應(yīng)用，并上機(jī)模擬操作Demo數(shù)據(jù)的生信分析等。誠(chéng)邀報(bào)名參加，本次培訓(xùn)班實(shí)行小班制（限額20人，報(bào)滿(mǎn)截止）。
主辦單位：上海生物芯片有限公司/生物芯片上海國(guó)家工程研究中心
培訓(xùn)日期：2019年6月28日-29日
培訓(xùn)地點(diǎn)：上海市浦東新區(qū)張江高科技園區(qū)李冰路151號(hào)1號(hào)樓
培訓(xùn)地點(diǎn)：上海市浦東新區(qū)張江高科技園區(qū)李冰路151號(hào)1號(hào)樓
一、日程安排：
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時(shí)間 |
主題 |
課程內(nèi)容 |
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6月28日 |
單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)介紹 |
單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的發(fā)展及10Xgenomic單細(xì)胞測(cè)序原理介紹 |
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樣本準(zhǔn)備 |
單細(xì)胞樣本準(zhǔn)備及常見(jiàn)問(wèn)題 | |
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Demo實(shí)驗(yàn) | ||
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R語(yǔ)言基礎(chǔ) |
R基本概念：向量、數(shù)組和矩陣、函數(shù)；R從文件讀取數(shù)據(jù)、根據(jù)需要編輯、轉(zhuǎn)換數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)；文件圖表等的生成導(dǎo)出 | |
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10X單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析流程及原理介紹 |
Cellranger運(yùn)行環(huán)境、服務(wù)器配置，如何從fastq生成表達(dá)矩陣等系列結(jié)果；Seurat的使用、算法解析等 | |
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10X單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析上機(jī)操作 |
在R交互環(huán)境運(yùn)行Seurat、向量準(zhǔn)備、畫(huà)圖函數(shù)使用、數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)解剖處理等；R畫(huà)圖包括PCA、tSNE、VlnPlot、PCHeatmap等 | |
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6月29日 |
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組結(jié)果報(bào)告解讀 |
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組結(jié)果報(bào)告解讀 |
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10X單細(xì)胞ATAC-seq分析流程及原理介紹 |
cellranger-atac運(yùn)行、運(yùn)行過(guò)程中使用算法介紹及結(jié)果解讀 | |
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10X單細(xì)胞ATAC-seq分析上機(jī)操作 |
Loupe Cell Browser軟件運(yùn)行、ChIPseeker對(duì)peaks結(jié)果注釋、Cicero介紹 | |
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單細(xì)胞高級(jí)分析 |
Monocle的原理算法介紹；
高分文章案例數(shù)據(jù)集作圖：擬時(shí)序、譜系分析等 | |
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單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的應(yīng)用與實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)思路解析 |
單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的應(yīng)用與實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)思路解析 |
二、費(fèi)用及優(yōu)惠：
1、培訓(xùn)費(fèi)用：2000元/人，包含培訓(xùn)費(fèi)、資料費(fèi)、培訓(xùn)期間午餐費(fèi)。
2、報(bào)名優(yōu)惠：
· 所產(chǎn)生的培訓(xùn)費(fèi)用可在后續(xù)訂購(gòu)SBC服務(wù)產(chǎn)品時(shí)抵扣等額的合同款項(xiàng)（每份服務(wù)合同只能抵扣一人培訓(xùn)費(fèi)用），有效期至2019年12月31日為止。
· 團(tuán)體報(bào)名（同一單位2人及以上）享受9折優(yōu)惠價(jià)。
· 以上2項(xiàng)優(yōu)惠條件可同時(shí)享受。
3、其他說(shuō)明
· 以匯款憑證(截圖、掃描件)或?qū)嶋H到款為成功報(bào)名
· 學(xué)員需自己攜帶筆記本電腦參加上機(jī)課程（電腦配置及軟件要求：報(bào)名成功后通知）。
· 早晚餐、交通及住宿費(fèi)用等請(qǐng)自理。
三、報(bào)名方式：
手機(jī)掃碼報(bào)名，或點(diǎn)擊此處填寫(xiě)報(bào)名信息。本次培訓(xùn)班限額20名，報(bào)名截止日期至2019年6月15日，報(bào)滿(mǎn)將提前截止。
四、匯款信息：（匯款時(shí)請(qǐng)注明：培訓(xùn)班+姓名）
名稱(chēng)：上海生物芯片有限公司
開(kāi)戶(hù)行：中國(guó)銀行上海浦東分行
賬號(hào)：4572 5921 5312
五、報(bào)名咨詢(xún)：
上海生物芯片有限公司/生物芯片上海國(guó)家工程研究中心
2019年5月21日
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