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SBC單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及生信分析培訓(xùn)班報(bào)名通知

瀏覽次數(shù)：11586　發(fā)布日期：2019-9-27　來(lái)源：本站　本站原創(chuàng)，轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明出處

自今年6月第一期單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及生信分析培訓(xùn)班成功舉辦以來(lái)，陸續(xù)收到新用戶詢問(wèn)單細(xì)胞測(cè)序的培訓(xùn)課程，結(jié)合第一期學(xué)員的反饋和建議，SBC茲定于2019年10月24日-26日再次舉辦第二期進(jìn)階版的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及生信分析培訓(xùn)班。針對(duì)學(xué)員們的不同需求，本次培訓(xùn)班為期三天，包含基礎(chǔ)課程（第1天）及進(jìn)階課程（第2-3天）兩部分。

課程內(nèi)容涵蓋10Xgenomic單細(xì)胞測(cè)序原理、樣本準(zhǔn)備、分析流程及原理、R語(yǔ)言基礎(chǔ)、高級(jí)分析以及實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)策略等。本次培訓(xùn)班特別邀請(qǐng)到上海交通大學(xué)系統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)研究院副研究員鄒欣博士在第三天的課程中授課。

誠(chéng)摯邀請(qǐng)各位老師報(bào)名參加，本次培訓(xùn)班實(shí)行小班制（限額20人）。

主辦單位：上海生物芯片有限公司/生物芯片上海國(guó)家工程研究中心

培訓(xùn)日期：2019年10月24日-26日
培訓(xùn)地點(diǎn)：上海市浦東新區(qū)張江高科技園區(qū)李冰路151號(hào)1號(hào)樓

一、 日程安排（暫定）

日期	時(shí)間	主題	課程內(nèi)容
10月24日第一天	08:45-09:00	簽到、領(lǐng)取資料
	09:00-09:10	開課致辭
	09:10-10:00	非編碼RNA研究概述及數(shù)據(jù)解讀
	10:00-11:00	R語(yǔ)言基礎(chǔ)	基本概念：向量、數(shù)組和矩陣、函數(shù)；數(shù)據(jù)導(dǎo)入、編輯、數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)換；文件圖表生成、導(dǎo)出
	11:10-11:40	R語(yǔ)言進(jìn)階：統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)，差異基因計(jì)算
	13:00-14:00	ggplot2詳解（柱狀圖、餅圖、boxplot、小提琴圖、密度曲線圖，散點(diǎn)圖，差異基因可視化（火山圖）等）
	14:00-14:40	如何畫非常牛的hclust層次聚類圖
	15:00-15:30	heatmap詳解&韋恩圖詳解
	15:40-16:40	GEO數(shù)據(jù)庫(kù)詳解及常用文章繪圖（誤差線圖、生存曲線圖、jitterplot）
10月25日第二天	08:45-09:00	簽到、領(lǐng)取資料
	09:00-09:10	開課致辭
	09:10-09:55	單細(xì)胞測(cè)序介紹	單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的發(fā)展及10Xgenomic單細(xì)胞測(cè)序原理介紹
	10:00-10:30	樣本準(zhǔn)備	單細(xì)胞樣本準(zhǔn)備及常見問(wèn)題
	10:40-11:30		Demo實(shí)驗(yàn)
	13:10-13:40	10X單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析原理及流程介紹
	13:45-14:00	10XGenomoics 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析介紹與上機(jī)實(shí)操	Cellranger運(yùn)行環(huán)境、服務(wù)器配置，如何從fastq生成表達(dá)矩陣等系列結(jié)果; Loupe Cell Browser軟件使用
	14:05-15:40	單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)多樣本比較分析介紹與上機(jī)實(shí)操	使用Seurat進(jìn)行全套單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析演練：常見7類分析圖：DimPlot_Integret、DotPlot、FeaturePlot整合圖等的代碼解析
	15:45-16:15	單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組結(jié)果報(bào)告解讀
	16:20-17:00	10X單細(xì)胞ATAC-seq分析流程及原理介紹	CellRanger-ATAC運(yùn)行、運(yùn)行過(guò)程中使用算法介紹及結(jié)果解讀； Loupe Cell Browser軟件運(yùn)行、ChIPseeker對(duì)peaks結(jié)果注釋、Cicero介紹
10月26日第三天	09:00-09:40	單細(xì)胞ATAC結(jié)果報(bào)告解讀
	09:55-11:30	單細(xì)胞數(shù)據(jù)中的噪聲干擾以及解決方案特邀嘉賓：上海交通大學(xué)副研究員鄒欣博士
	13:00-14:00	高級(jí)分析案例分析；流程演練+實(shí)操過(guò)程答疑	1、Monocle的原理算法介紹；2、高分文章案例數(shù)據(jù)集作圖：擬時(shí)序分析等
	14:10-15:00	單細(xì)胞RNA測(cè)序數(shù)據(jù)的聚類工具比較介紹	聚類方法比較（包括Seurat、Cell Ranger、SC3、ascend、RaceID）
	15:30-16:30	單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的應(yīng)用與實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)思路解析
	16:30-16:40	頒發(fā)證書、合影

二、費(fèi)用及優(yōu)惠

1、培訓(xùn)費(fèi)用：

培訓(xùn)課程	課程時(shí)間	培訓(xùn)費(fèi)
基礎(chǔ)班	10月24日（共1天）	1000元/人
進(jìn)階班	10月25日-26日（共2天）	2000元/人
實(shí)戰(zhàn)班	10月24日-26日（共3天）	2800元/人
注：以上費(fèi)用包含培訓(xùn)費(fèi)、資料費(fèi)、培訓(xùn)期間午餐費(fèi)。