單克隆抗體分子在藥物研發(fā)、診斷試劑開發(fā)中扮演了關(guān)鍵的角色。抗體分子本身的一級結(jié)構(gòu)，特別是其CDR區(qū)域的氨基酸序列是發(fā)揮其生物學(xué)功能的核心，對其完整序列準(zhǔn)確快速的分析具有十分重要的意義。例如對市場上已有的抗體產(chǎn)品直接進(jìn)行序列分析是開發(fā)抗體藥物，抗體診斷試劑和其它抗體產(chǎn)品的捷徑；許多商業(yè)可得的抗體對于藥物靶點(diǎn)有中和活性，通過單抗序列測定得到該抗體的一級序列，可以以此為基礎(chǔ)可進(jìn)行抗體親和力提升和人源化來開發(fā)抗體藥物；在進(jìn)行抗體仿制藥物研發(fā)過程中，原研藥本身準(zhǔn)確的一級結(jié)構(gòu)信息是進(jìn)行抗體仿制藥研發(fā)的基礎(chǔ)和前提。
百泰派克公司基于先進(jìn)的高分辨率質(zhì)譜儀Obitrap Fusion Lumos，結(jié)合豐富的生物信息學(xué)分析經(jīng)驗(yàn)，建立了全新一代抗體測序平臺(tái)，實(shí)現(xiàn)對抗體一級結(jié)構(gòu)快速準(zhǔn)確的分析。該平臺(tái)適用于不同亞型抗體（例如IgG和IgM）和不同類型抗體（熒光偶聯(lián)抗體，固定化抗體，不同物種的抗體）的序列分析。

單克隆抗體從頭測序服務(wù)流程

1. 單抗輕重鏈肽段全序列覆蓋
在進(jìn)行抗體序列測定過程中百泰派克會(huì)選擇5種不同的蛋白酶進(jìn)行酶切，利用不同酶切肽段之間的互補(bǔ)性實(shí)現(xiàn)抗體分子輕重鏈100%全序列的拼接。而對于抗體核心區(qū)域CDR序列在進(jìn)行序列分析過程中要求至少被鑒定到10次，以此來充分保證測序結(jié)果的準(zhǔn)確性（如下圖所示）。

單克隆抗體從頭測序2

2. 先進(jìn)的數(shù)據(jù)處理算法
百泰派克基于發(fā)表在Nature Biotechnology和專業(yè)的蛋白組學(xué)雜志JPR上的文獻(xiàn)，結(jié)合現(xiàn)有的專業(yè)進(jìn)行抗體序列分析的軟件PEAKS Mass Spectrometry Software，開發(fā)了自己的質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)計(jì)算方法，采用寬進(jìn)窄出的原則，在不遺漏任何有效數(shù)據(jù)信息的同時(shí)實(shí)現(xiàn)了抗體序列的準(zhǔn)確鑒定。

3. 高精度和準(zhǔn)確性
百泰派克在測序過程中會(huì)使用目前分辨率和高靈敏度Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀；與老一代的質(zhì)譜儀（例如Obitrap Elite、Q Exactive等）相比，Lumos在提高了一級二級質(zhì)譜掃描速度的同時(shí)保證肽段分子量的準(zhǔn)確性；一級質(zhì)譜掃描速度的提高，有助于同一個(gè)肽段可以更多次的被鑒定到，提高了結(jié)果的可信性；二級質(zhì)譜掃描速度的提高可以更好的進(jìn)行片段碎裂（如下圖所示），從而保證結(jié)果的準(zhǔn)確性，并可以通過二級碎裂片段的特征峰實(shí)現(xiàn)亮氨酸和異亮氨酸的準(zhǔn)確判定。

單克隆抗體從頭測序3

4. 可對多種亞型和不同類型的抗體進(jìn)行測序
我們建立的技術(shù)平臺(tái)不受小基團(tuán)（如FITC、Biotin、Alexa）的影響，雖然較大的蛋白基團(tuán)會(huì)給測序帶來難度，但若提供較高濃度的蛋白仍可成功測序。

5. 嚴(yán)謹(jǐn)?shù)男蛄蓄A(yù)測和嚴(yán)格的序列驗(yàn)證
我們對測序的結(jié)果會(huì)首先進(jìn)行序列的預(yù)測，標(biāo)明抗體的CDR區(qū)域（如下圖所示）；同時(shí)，我們還會(huì)以測定的序列建立新的數(shù)據(jù)庫，采用Sequence Confirmation的模式對采集到的質(zhì)譜數(shù)據(jù)再次進(jìn)行分析，只有完全匹配的結(jié)果我們才會(huì)提供給客戶。

單克隆抗體從頭測序4

在技術(shù)報(bào)告中，百泰派克生物科技會(huì)為您提供詳細(xì)的中英文雙語版技術(shù)報(bào)告，報(bào)告包括：

1. 實(shí)驗(yàn)步驟（中英文）
2. 相關(guān)的質(zhì)譜參數(shù)（中英文）
3. 質(zhì)譜圖片
4. 原始數(shù)據(jù)
5. 肽段序列信息
6. 抗體序列信息