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蛋白膠點(diǎn)、膠條、IP樣品蛋白鑒定
無(wú)論是蛋白膠點(diǎn)、膠條,還是IP樣品中的蛋白,百泰派克質(zhì)譜依賴蛋白鑒定服務(wù),均能為您的實(shí)驗(yàn)問(wèn)題帶來(lái)最佳解決方案。
服務(wù)類別:分子與細(xì)胞總訪問(wèn):38078
最后更新:2023-11-16半年訪問(wèn):31
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百泰派克生物結(jié)合MALDI-TOF質(zhì)譜系統(tǒng)與LC-MS/MS質(zhì)譜系統(tǒng),提供專業(yè)準(zhǔn)確的蛋白膠點(diǎn)、膠條、IP樣品,CO-IP樣品蛋白鑒定服務(wù)。可鑒定的樣品包括:1D-SDS PAGE分離的蛋白膠條,2DE PAGE中的蛋白膠點(diǎn),蛋白表達(dá)產(chǎn)物,免疫共沉淀(Co-IP)樣品。其中,蛋白質(zhì)樣品的鑒定前處理過(guò)程嚴(yán)格按照Nature Methods發(fā)表的文章:Universal sample preparation method for proteome analysis進(jìn)行,保證鑒定試驗(yàn)中得到更高的肽段覆蓋率。質(zhì)譜鑒定的原理則是基于鳥槍法(Shot-gun):將蛋白條帶或者蛋白溶液酶切成肽段混合物,經(jīng)高效液相色譜分離得到若干較為簡(jiǎn)單的組分,進(jìn)入高分辨率質(zhì)譜儀中進(jìn)行分析。檢索軟件根據(jù)二級(jí)質(zhì)譜信息與相應(yīng)的數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì),結(jié)合匹配度打分及錯(cuò)配過(guò)濾,可得到肽段的確切序列,進(jìn)而拼接出各蛋白的完整序列,從而實(shí)現(xiàn)對(duì)蛋白的鑒定。

蛋白質(zhì)質(zhì)譜鑒定流程

基于鳥槍法(shot-gun)LC-MS的蛋白鑒定流程

關(guān)于樣品

1D SDS PAGE /2D PAGE gels樣品:
1. Coomassie Blue, SYPRO Ruby 以及Silver stain樣品均可進(jìn)行蛋白的鑒定試驗(yàn);
2. 銀染的樣品有可能與后續(xù)的質(zhì)譜分析不兼容,我們推薦您使用下面的產(chǎn)品或者實(shí)驗(yàn)步驟進(jìn)行銀染實(shí)驗(yàn):
ProteoSilver Plus, Sigma (Product # PROTSIL1 or PROTSIL2)
Dodeca Silver Stain, BioRad (Product # 161-0481 or 161-0480)
3. 銀染的樣品請(qǐng)不要進(jìn)行脫色處理

液體樣品(In solution format):
1. 假如樣品中蛋白量>10ug,我們對(duì)樣品的緩沖體系沒有要求;
2. 假如樣品中蛋白量<10ug,樣品準(zhǔn)備過(guò)程中盡量減少SDS等表面活性劑的使用,并注意降低鹽濃度;
3. 提交樣品過(guò)程中,注意提供樣品的緩沖體系和樣品中蛋白的預(yù)估含量;

Co-IP樣品:
1. 如果您洗脫的樣品需要跑膠,請(qǐng)按照1D SDS PAGE樣品準(zhǔn)備要求準(zhǔn)備樣品即可;
2. 如果您直接提交洗脫樣品,我們推薦使用HPH EB (0.5 M NH4OH, 0.5 mM EDTA) 緩沖體系進(jìn)行蛋白洗脫,保證洗脫緩沖體系與后續(xù)的質(zhì)譜實(shí)驗(yàn)兼容;

樣品運(yùn)輸:
1. 我們推薦您將樣品凍干后進(jìn)行運(yùn)輸,凍干樣品中蛋白非常穩(wěn)定。
2. 液體樣品推薦干冰運(yùn)輸,短途運(yùn)輸冰袋也可以。

注意事項(xiàng): 利用質(zhì)譜進(jìn)行蛋白樣品的鑒定,在樣品準(zhǔn)備過(guò)程中需佩戴手套和頭套,盡量避免自身角蛋白(keratin)對(duì)樣品的污染。

研究案例

該項(xiàng)目是中國(guó)科學(xué)院生物物理所一位老師將她的Co-IP的樣品寄給我們進(jìn)行蛋白鑒定。得到的部分結(jié)果如下圖所示:

蛋白膠點(diǎn)、膠條、IP樣品蛋白鑒定研究案例

從圖中可以看出,我們提供的結(jié)果報(bào)告中包含鑒定到的蛋白的Accession Number, Peptide coverage, 鑒定出的肽段信息,鑒定出的肽段的修飾信息以及對(duì)鑒定到的蛋白的詳細(xì)描述。

中/英文項(xiàng)目報(bào)告:

在技術(shù)報(bào)告中,百泰派克會(huì)為您提供詳細(xì)的中英文雙語(yǔ)版技術(shù)報(bào)告,報(bào)告包括:

1. 實(shí)驗(yàn)步驟(中英文)
2. 相關(guān)的質(zhì)譜參數(shù)(中英文)
3. 質(zhì)譜圖片
4. 原始數(shù)據(jù)
5. 鑒定的蛋白質(zhì)詳細(xì)信息

蛋白膠點(diǎn)、膠條、IP樣品質(zhì)譜鑒定一站式服務(wù)

您只需下單-寄送樣品
百泰派克一站式服務(wù)完成:樣品處理-上機(jī)分析-數(shù)據(jù)分析-項(xiàng)目報(bào)告

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