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基于iTRAQ的定量蛋白組分析
百泰派克公司采用Q ExactiveHF質(zhì)譜平臺,Orbitrap Fusion質(zhì)譜平臺,Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC,推出基于iTRAQ的定量蛋白組分析服務(wù)
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最后更新:2023-11-16半年訪問:30
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BTP-基于iTRAQ的定量蛋白組分析

iTRAQ (Isobaric Tags for Relative and Absolute Quantitation)即等重標(biāo)簽標(biāo)記用于蛋白質(zhì)相對和絕對定量技術(shù)。它是美國Applied Biosystems公司研發(fā)的蛋白質(zhì)組定量專利技術(shù)。該技術(shù)可實(shí)現(xiàn)對多種不同樣品中蛋白的比較,如用于研究不同病理?xiàng)l件下或者不同發(fā)育階段的組織樣品中蛋白質(zhì)表達(dá)水平的差異。 來自不同樣品的同一肽段經(jīng) iTRAQ 試劑標(biāo)記后具有相同的質(zhì)量數(shù),并在一級質(zhì)譜檢測(MS1)中表現(xiàn)為同一個質(zhì)譜峰。當(dāng)此質(zhì)譜峰被選定進(jìn)行碎裂后,在二級質(zhì)譜檢測(MS2)中,不同的報告基團(tuán)被釋放,它們各自的質(zhì)譜峰的信號強(qiáng)弱,代表著來源于不同樣品的該肽段及其所對應(yīng)的蛋白的表達(dá)量的高低。

百泰派克公司采用Thermo Fisher的Q ExactiveHF質(zhì)譜平臺,Orbitrap Fusion質(zhì)譜平臺,Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC,推出基于iTRAQ的定量蛋白組分析服務(wù)技術(shù)包裹,您只需要將您的實(shí)驗(yàn)?zāi)康母嬖V我們并將您的蛋白寄給我們,我們會負(fù)責(zé)項(xiàng)目后續(xù)所有事宜,包括蛋白酶切、肽段標(biāo)價、肽段分離、質(zhì)譜分析、質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)分析、生物信息學(xué)分析。

關(guān)于樣品

1. 如果您提供的是組織樣品,請您干冰將組織樣品寄給我們;植物組織樣本最少200mg,血液樣品至少1ml(血漿注意用EDTA防凝),血清0.2-0.5ml,尿液2ml,動物組織樣品至少1g,細(xì)胞樣品為1X107個細(xì)胞,酵母、微生物等干重200mg。

2. 如果您提供的是蛋白樣品,請您保證蛋白總量在100ug以上;蛋白提取時使用普通的組織、細(xì)胞裂解液即可。

3. 樣品運(yùn)輸:請使用足量的干冰運(yùn)輸,并且盡量選用較快的郵遞方式,以降低運(yùn)輸過程中樣品降解的可能性。

一站式服務(wù)

您只需下單-寄送樣品

百泰派克一站式服務(wù)完成:樣品處理-上機(jī)分析-數(shù)據(jù)分析-項(xiàng)目報告

對于可以傳代的細(xì)胞樣品來說,我們可以采取SILAC的方法完成對于細(xì)胞蛋白質(zhì)組的標(biāo)記過程,但是許多其他研究體系,比如組織樣品以及不能進(jìn)行傳代培養(yǎng)的細(xì)胞來說,需要其他的標(biāo)記方法來完成定量蛋白組學(xué)分析。iTRAQ技術(shù)就是基于此實(shí)驗(yàn)需求建立起來的體外(in vitro)標(biāo)記技術(shù)。

iTRAQ試劑包括三部分:

1. 報告基團(tuán)(reporter group):相對分子量為113-121Da(無120),因此iTRAQ試劑可同時標(biāo)記8組樣品。

2. 平衡基團(tuán)(balance group):相對分子量為192-184Da (無185),使得八種iTRAQ試劑分子量均為305 Da,保證標(biāo)記的同一肽段m/z相同。

3. 肽反應(yīng)基團(tuán):能與肽段N端及賴氨酸側(cè)鏈氨基發(fā)生共價連接,從而標(biāo)記上肽段 拿到蛋白樣品之后,不同組的樣品首先分別進(jìn)行等量酶切,每一個酶切得到的肽段樣品選擇一種標(biāo)記試劑進(jìn)行標(biāo)記反應(yīng)(每一個肽段至少含有一個游離的氨基進(jìn)行反應(yīng));然后將經(jīng)過不同標(biāo)記的肽段樣品混合后進(jìn)行后續(xù)的質(zhì)譜分析。

來自不同樣品的同一肽段經(jīng)iTRAQ試劑標(biāo)記后具有相同的質(zhì)量數(shù),并在一級質(zhì)譜檢測(MS1)中表現(xiàn)為同一個質(zhì)譜峰。當(dāng)此質(zhì)譜峰被選定進(jìn)行碎裂后,在二級質(zhì)譜檢測(MS2)中,不同的報告基團(tuán)被釋放,它們各自的質(zhì)譜峰的信號強(qiáng)弱,代表著來源于不同樣品的該肽段及其所對應(yīng)的蛋白的表達(dá)量的高低。

基于iTRAQ的定量蛋白組研究路線

中/英文項(xiàng)目報告

在最終的技術(shù)報告中,百泰會為您提供詳細(xì)的中英文雙語版技術(shù)報告,報告包括:

1, 實(shí)驗(yàn)步驟(中英文)

2, 相關(guān)的質(zhì)譜參數(shù)(中英文)

3, 鑒定物質(zhì)的信息

4, 原始數(shù)據(jù)

5, 生物信息學(xué)分析

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