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糖基化定量蛋白組學(xué)研究
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BTP-糖基化定量蛋白組學(xué)研究

糖基化修飾是生命活動(dòng)中最廣泛、最重要的蛋白質(zhì)翻譯后修飾之一,不僅影響著蛋白質(zhì)的空間構(gòu)象、生物活性、運(yùn)輸和定位,而且在分子識(shí)別、細(xì)胞通信、信號(hào)轉(zhuǎn) 導(dǎo)等特定生物過程中發(fā)揮著至關(guān)重要的作用。糖蛋白根據(jù)其糖鏈結(jié)構(gòu)及糖基化位點(diǎn)主要有N-糖蛋白與O-糖蛋白兩大類。據(jù)推斷,有超過50%的蛋白質(zhì)都發(fā)生了糖基化修飾,但由于糖基化的高度復(fù)雜性, 絕大多數(shù)糖蛋白尚未被發(fā)現(xiàn),現(xiàn)有數(shù)據(jù)庫(kù)中只有約10%的蛋白質(zhì)被注釋為糖蛋白。僅僅由6個(gè)不同單糖組成的寡糖鏈,其結(jié)構(gòu)就可能達(dá)到驚人的1012種。其次,當(dāng)組 成與結(jié)構(gòu)各異的糖鏈連接在蛋白質(zhì)上形成糖蛋白時(shí),又 構(gòu)成微觀不均一性,即糖基化位點(diǎn)上糖鏈結(jié)構(gòu)多樣化的 問題,一個(gè)蛋白可能存在多個(gè)糖基化位點(diǎn),而每個(gè)位點(diǎn) 上又可能存在多種結(jié)構(gòu)的糖鏈。

百泰派克公司采用Thermo Fisher的Q ExactiveHF質(zhì)譜平臺(tái),Orbitrap Fusion質(zhì)譜平臺(tái),Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC,推出糖基化定量蛋白組分析服務(wù)技術(shù)包裹,您只需要將您的實(shí)驗(yàn)?zāi)康母嬖V我們并將您的樣品寄給我們,我們會(huì)負(fù)責(zé)項(xiàng)目后續(xù)所有事宜,包括蛋白提取、蛋白酶切、糖基化肽段富集、肽段分離、質(zhì)譜分析、質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)分析、生物信息學(xué)分析。

關(guān)于樣品

1. 如果您提供的是組織樣品,請(qǐng)您干冰將組織樣品寄給我們;植物組織樣本最少200mg,血液樣品至少1ml(血漿注意用EDTA防凝),血清0.2-0.5ml,尿液2ml,動(dòng)物組織樣品至少1g,細(xì)胞樣品為1X107個(gè)細(xì)胞,酵母、微生物等干重200mg。

2. 如果您提供的是蛋白樣品,請(qǐng)您保證蛋白總量在100ug以上;蛋白提取時(shí)使用普通的組織、細(xì)胞裂解液即可。

3. 樣品運(yùn)輸:請(qǐng)使用足量的干冰運(yùn)輸,并且盡量選用較快的郵遞方式,以降低運(yùn)輸過程中樣品降解的可能性。

一站式服務(wù)

您只需下單-寄送樣品

百泰派克一站式服務(wù)完成:樣品處理-上機(jī)分析-數(shù)據(jù)分析-項(xiàng)目報(bào)告

隨著質(zhì)譜分辨率的不斷提高和生物信息學(xué)的不斷發(fā)展, 質(zhì)譜已廣泛應(yīng)用于糖基化解析, 通常先利用酶切或化學(xué)手段將糖鏈從糖蛋白釋放, 再分別進(jìn)行糖基化位點(diǎn)的鑒定和糖鏈結(jié)構(gòu)的解析。然而針對(duì)完整糖肽的解析,目前尚無成熟技 術(shù)。百泰派克公司利用新一代組合型質(zhì)譜Orbitrap Fusion具有的 HCD/ETD"雙碎裂模式", 解析復(fù)雜糖蛋白的完整糖肽, 然后利用最新Byonic軟件對(duì)質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)解析, 實(shí)現(xiàn)對(duì)N-糖基化位點(diǎn)和O-糖基化位點(diǎn)的鑒定,并對(duì)相應(yīng)位點(diǎn)攜帶的糖鏈組成進(jìn)行分析。

糖基化修飾研究路線

 

中/英文項(xiàng)目報(bào)告

在最終的技術(shù)報(bào)告中,百泰會(huì)為您提供詳細(xì)的中英文雙語(yǔ)版技術(shù)報(bào)告,報(bào)告包括:

1, 實(shí)驗(yàn)步驟(中英文)

2, 相關(guān)的質(zhì)譜參數(shù)(中英文)

3, 翻譯后修飾位點(diǎn)信息

4, 原始數(shù)據(jù)

5, 生物信息學(xué)分析

研究案例

該項(xiàng)目是某高校老師植物樣品在百泰派克進(jìn)行蛋白糖基化修飾位點(diǎn)鑒定。得到的部分結(jié)果如下圖所示:

 

糖基化修飾研究案例

中/英文項(xiàng)目報(bào)告

在技術(shù)報(bào)告中,百泰派克會(huì)為您提供詳細(xì)的中英文雙語(yǔ)版技術(shù)報(bào)告,報(bào)告包括:

1. 實(shí)驗(yàn)步驟(中英文)
2. 相關(guān)的質(zhì)譜參數(shù)(中英文)
3. 鑒定的糖基化位點(diǎn)的詳細(xì)信息
4. 質(zhì)譜圖片
5. 原始數(shù)據(jù)

BTP-糖基化定量蛋白組學(xué)一站式服務(wù)

您只需下單-寄送樣品 百泰派克一站式服務(wù)完成:樣品處理-上機(jī)分析-數(shù)據(jù)分析-項(xiàng)目報(bào)告

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