小鼠轉(zhuǎn)基因的“三段進(jìn)階”。
這里我們說的轉(zhuǎn)基因小鼠是指:將一段外源基因隨機(jī)插入到小鼠基因組中,獲得過量表達(dá)目的基因的小鼠模型。
轉(zhuǎn)基因1.0 顯微注射法構(gòu)建完全隨機(jī)插入轉(zhuǎn)基因小鼠
用顯微注射針將線性化的外源DNA片段直接注入小鼠受精卵的原核中,使外源基因整合到小鼠基因組中,從而獲得轉(zhuǎn)基因小鼠。
優(yōu)點(diǎn):
缺點(diǎn):
也就是說:
外源DNA是怎么整合到小鼠基因組里的,你不知道。
外源DNA整合在哪里,你也不知道。
外源DNA到底有幾個(gè)拷貝整合進(jìn)去了,你還是不知道。
外源DNA整合進(jìn)去以后能不能被表達(dá)出來,你就更不知道了。
說白了,全靠RP。
不過有一點(diǎn)你可以知道,那就是獲得的founder小鼠越多,篩選到高表達(dá)line的可能性就越高。
轉(zhuǎn)基因2.0 利用DNA轉(zhuǎn)座子系統(tǒng)提高轉(zhuǎn)基因的表達(dá)陽性率
DNA轉(zhuǎn)座子的轉(zhuǎn)座遵循 “切離-粘貼 (cut and paste)”機(jī)制,在轉(zhuǎn)座酶 (transposase)的催化下 ,DNA轉(zhuǎn)座子及中間的DNA片段被從原始位置切離并插入到新的基因組位置。
用到轉(zhuǎn)基因小鼠制備的過程中,就是將外源待表達(dá)的DNA片段構(gòu)建到轉(zhuǎn)座子質(zhì)粒中去,并和轉(zhuǎn)座酶mRNA一起顯微注射到小鼠受精卵中,轉(zhuǎn)座酶將外源DNA片段從質(zhì)粒中切離下來,插入到小鼠基因組中去。
常用于哺乳動(dòng)物轉(zhuǎn)基因的轉(zhuǎn)座子有:piggyBac、SleepingBeauty (SBll) 和Tol2。其中,piggyBac轉(zhuǎn)座子在轉(zhuǎn)座酶的輔助下特異性識(shí)別基因組中5’-TTAA-3’位點(diǎn),精確地剪切和插入不留下印跡;并且在隨機(jī)插入基因組的過程中,更傾向于插入有活躍轉(zhuǎn)錄的位置;而且轉(zhuǎn)座效率比其他兩個(gè)高。
轉(zhuǎn)基因1.0 vs 2.0的性能對(duì)比
從這張表格中,你不難發(fā)現(xiàn) 2.0進(jìn)階版雖然仍舊不能確定整合位點(diǎn)與外源DNA的插入數(shù)量,但在相同的制備周期里, 2.0進(jìn)階版提高了外源基因表達(dá)的效率,很大程度上能夠避免轉(zhuǎn)基因1.0“竹籃打水一場(chǎng)空”的遺憾,不失為性價(jià)比更高的一種方式。
當(dāng)然,如果你和小編一樣,對(duì)不確定的事情特別沒有安全感,又對(duì)自己的RP沒什么自信的話,一定馬上就要發(fā)出這樣的怒吼了:難道就沒有一種既能明確而準(zhǔn)確地插入外源基因又能保證表達(dá)的方法嗎?
轉(zhuǎn)基因3.0 定點(diǎn)轉(zhuǎn)基因 —— “一清二白”的過表達(dá)神器
一清:
整合位點(diǎn)清楚
二白:
1)整合拷貝數(shù)明白
2)不需要建系,后代小鼠基因型明白
更重要的是:外源基因表達(dá)有保證!
Rosa26位點(diǎn)是目前最為常用的定點(diǎn)整合位點(diǎn)之一。它位于小鼠6號(hào)染色體,是一個(gè)非編碼基因,已被證明在大部分組織和細(xì)胞中都有表達(dá)。表達(dá)比較活躍的基因區(qū)域因?yàn)樾枰D(zhuǎn)錄因子的進(jìn)入基因組結(jié)構(gòu)不會(huì)被異染色質(zhì)化,因此在這個(gè)區(qū)域定點(diǎn)插入外源基因,在各組織中表達(dá)的可能性都非常高。所以,Rosa26被廣泛用來作為外源基因表達(dá)的安全位點(diǎn)。當(dāng)然,還有一些其它的安全位點(diǎn),我們下期再詳細(xì)介紹哈~
外源DNA片段怎么整合到Rosa26位點(diǎn)里呢?依靠同源重組。
無論是ES細(xì)胞打靶還是CRISPR途徑,都需要構(gòu)建一個(gè)同源重組載體,在Rosa26基因兩段同源臂之間放上外源基因片段。一般情況下,為了實(shí)現(xiàn)外源基因的高表達(dá),可以選擇類似CAG啟動(dòng)子這樣的廣泛型強(qiáng)啟動(dòng)子。在組成型表達(dá)的基礎(chǔ)上,我們還可以更靈活地實(shí)現(xiàn)條件性——組織特異性或時(shí)間特異性——過表達(dá),方法很簡(jiǎn)單,就是在啟動(dòng)子和外源cDNA之間加上一段兩側(cè)帶有l(wèi)oxP位點(diǎn)的multi-polyA轉(zhuǎn)錄終止(STOP)信號(hào),像這樣:
構(gòu)建一個(gè)定點(diǎn)轉(zhuǎn)基因小鼠花費(fèi)的時(shí)間會(huì)長(zhǎng)一些,即使采用CRISPR技術(shù)也要6個(gè)月左右。不過話說回來,如果算上隨機(jī)插入轉(zhuǎn)基因小鼠的建系時(shí)間,小編覺得定點(diǎn)轉(zhuǎn)基因還是更有優(yōu)勢(shì)噠~
你也許還會(huì)問,靠同源重組能插入幾十kb那么大的片段嗎?
不用怕,我們可以用RMCE(重組酶介導(dǎo)的盒式交換)來解決超大片段的定點(diǎn)過表達(dá)難題哦!RMCE技術(shù)基于利用Rosa26位點(diǎn)中帶有側(cè)翼為特定重組酶識(shí)別位點(diǎn)(例如:loxP、lox511位點(diǎn)或F3、Frt位點(diǎn))的工具ES細(xì)胞系。構(gòu)建帶有外源片段的第二個(gè)轉(zhuǎn)基因(側(cè)翼也帶有特異性重組酶識(shí)別位點(diǎn))交換質(zhì)粒,在表達(dá)重組酶(例如Cre或Flpe)的幫助下在ES細(xì)胞中催化盒式交換,從而完成超大片段(20-30kb)的定點(diǎn)整合。就像這樣:
轉(zhuǎn)基因的方法很多,不同方法有它各自的優(yōu)缺點(diǎn),綜合考量,選擇最適合方法~