一文讀懂腸道菌群非靶標(biāo)代謝組學(xué)
瀏覽次數(shù):1511 發(fā)布日期:2021-4-23
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人體內(nèi)腸道微生物數(shù)量高達(dá)100萬(wàn)億個(gè),接近自身細(xì)胞總量的10倍,是人體的“第二基因組”,也被稱為“人體另一個(gè)器官”。大量研究表明腸道菌群與糖尿病、肝臟疾病、心腦血管疾病、腎病、艾滋病、腫瘤等多種疾病密切相關(guān),在人類健康和疾病中發(fā)揮著至關(guān)重要的作用。腸道菌群通過(guò)產(chǎn)生的代謝物對(duì)人體產(chǎn)生影響。運(yùn)用代謝組學(xué)檢測(cè)腸菌代謝物的動(dòng)態(tài)變化,清晰展示腸道菌群在宿主中的代謝狀態(tài),可更加直觀的研究腸道菌群與疾病發(fā)生發(fā)展的關(guān)系,從而為疾病的預(yù)防和治療,提高宿主的健康水平提供新的思路。通過(guò)KEGG、BIOML、CGR、HBC、GMrepo等數(shù)據(jù)庫(kù)結(jié)合文獻(xiàn)及宏基因組深度測(cè)序數(shù)據(jù),Biotree自主構(gòu)建了腸道菌群代謝組數(shù)據(jù)庫(kù),覆蓋2800+個(gè)菌株,1200+個(gè)腸道菌群相關(guān)代謝物,不僅可有效對(duì)代謝物進(jìn)行溯源分類,而且代謝物可精細(xì)溯源到具體菌株(部分為種屬),將大大助力腸道菌群與健康作用機(jī)制研究。
1.技術(shù)優(yōu)勢(shì)
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覆蓋2800+個(gè)菌種,1200+個(gè)腸道菌群相關(guān)代謝物,代謝物數(shù)量、菌株數(shù)量龐大;
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不僅可對(duì)眾多物種的代謝物進(jìn)行溯源分類,而且代謝物可以溯源到菌株;
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代謝物可以確定上下游關(guān)系(如果是可逆反應(yīng)則無(wú))及調(diào)控基因/酶。
2.技術(shù)路線

3.技術(shù)參數(shù)
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樣本要求
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糞便、腸道內(nèi)容物 200 mg/sample
血清、血漿 200 μL/sample
培養(yǎng)液 ≥200 μL/sample(推薦0.5mL/sample)
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檢測(cè)平臺(tái)
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UHPLC-QTOF-MS/UHPLC-QE-MS
4.應(yīng)用方向
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腸道菌群代謝物動(dòng)態(tài)變化研究;
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腸道菌群差異代謝物篩選;
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腸道菌群在疾病發(fā)生發(fā)展中的作用機(jī)理研究。
5.案例分析
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高膽固醇飲食與脂肪肝相關(guān)肝癌的關(guān)系,終于有研究證據(jù)了!
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小小腸道菌群決定腎的“生死”
6.延伸閱讀
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腸道菌群研究新策略——腸菌代謝物及其功能研究
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Biotree腸道菌群代謝組學(xué)助力腸道菌功能研究
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