小鼠微生物組的穩(wěn)定性影響實驗結果?如何解決?
好激動!😄新的研究項目要開展起來了!
但是卻不知道如何挑選小鼠品系😭
小鼠品系的選擇對于研究結果至關重要。
特別是可以從多個來源(比如不同供應商、當?shù)匮芯恐行倪是合作者)獲得類似品系的情況下。
那么,小鼠品系該如何選擇呢?

不同來源的小鼠的微生物群落差異較大,而這個差異可能會影響實驗結論——這是一個非常重要但是常常被忽略的信息。
例如,一項研究報告了
Th17免疫細胞豐度的巨大差異。Th17免疫細胞是小腸炎癥反應的重要群體,這些細胞可能受腸道微生物群體的影響 (Ivanov 2008 Cell Host Microbe, PMID 18854238)。有研究者比較了不同來源的C57BL/6品系中Th17 胞的豐度,包括多個基礎研究的實驗室和商業(yè)供應商(例如 Taconic)。
結果表明,和其他來源比起來,
杰克森實驗室 (JAX) 小鼠的Th17 胞非常少。后來的研究明確了其中的原因,即腸道分節(jié)絲狀菌 (segmented filamentous bacteria, SFB)可以誘導Th17細胞發(fā)育,該發(fā)育過程在缺乏SFB 小鼠中受阻(Ivanov 2009 Cell PMID 19836068)。
其實,不同機構的小鼠微生物組差異化這一結果其實并不讓人意外,因為每家機構在食物、水和墊料來源、設施涉及以及操作實踐(包括健康檢測)等方面往往不盡相同。
除了這些外在因素外,
小鼠的內(nèi)在因素也會影響微生物特征:
由于遺傳漂變的存在,即使是名稱相似的小鼠品系,其精確的遺傳特征也會有所不同。
基于科學問題的復雜性,要提前預測哪些微生物會影響您的研究是極其困難的。因此,使用微生物組穩(wěn)定的小鼠模型開展實驗,確保得到穩(wěn)定、可重復的實驗結果,是規(guī)避此類風險的最優(yōu)的方式。
JAX小鼠具有
良好的腸道微生物組穩(wěn)定性
在過去一項研究中,我們報告了JAX的3種常用小鼠品系的微生物組在5個月內(nèi)均保持穩(wěn)定,且每個小鼠品系都有獨特的微生物特征。
這項觀察結果還促使我們開展了一項伴隨研究——我們比較了JAX小鼠與市面上其他2家主要供應商的類似品系的腸道微生物組。
結果發(fā)現(xiàn),
JAX不同設施的C57BL/6小鼠的腸道微生物相似性非常高,而而另外兩家供應商不同設施的C57BL/6小鼠則往往有所差異。(比較數(shù)據(jù)和采樣方法如圖所示)
(將不同JAX不同設施(Bar Harbor、Sacramento)的C57BL/6NJ和市面上另外兩家供應商(A和B)兩個設施(分別是W、X和Y、Z)的C57BL/6N小鼠運送至專門從事微生物組研究的學術動物研究機構。從收雄性和雌性小鼠身上采集新鮮的糞便樣本并進行16S rRNA V1V3區(qū)域的測序以比較微生物組成。來自JAX 的C57BL/6J小鼠樣本也包含在我們的分析中,作為評估亞系中細菌群落差異的參考。)
這個結果表明,JAX對多種健康狀況和不同設施的JAX小鼠的腸道微生物有較好的穩(wěn)定性。
決策至關重要
關于小鼠的采購來源,您需要做出許多決定,其中不能妥協(xié)的一個決定是所用小鼠的質量,因為這關系到研究結果的可重復性。
作為提供可靠研究模型的小鼠供應商,
JAX負責為世界各地的研究人員提供始終處于良好健康狀況的小鼠。我們希望通過這些健康狀況良好、遺傳背景清晰可靠的小鼠模型,助力每一位科學家,共同確?蒲薪Y果的可重復性。
為了確保小鼠的健康狀況和穩(wěn)定,JAX還設立了極為嚴格的流程和系統(tǒng)管理措施。
在JAX各個等級的SPF屏障中,“飼料;經(jīng)過濾的酸化飲用水;墊料和微隔離(單獨經(jīng)過 HEPA 過濾)籠等。籠具設備在高壓滅菌前通過隧道清洗機進行消毒。動物技術人員需遵守嚴格的房間進入程序,包括穿戴多種形式的個人防護裝備(包括面罩和頭罩)。“
最高等級的SPF屏障中,技術人員還必須穿戴經(jīng)HEPA過濾的空氣帽并通過風淋室入口,才能進入。
同時,JAX也設置了一套非常嚴密的健康檢測措施,以驗證上述過程并確保小鼠質量。
了解JAX通過哪些項目改善所生產(chǎn)小鼠的質量:
JAX健康監(jiān)測項目:
https://www.jax.org/jax-mice-and-services/customer-support/customer-service/animal-health/animal-health-program
JAX遺傳穩(wěn)定項目:
https://www.jax.org/jax-mice-and-services/find-and-order-jax-mice/why-jax-mice/patented-genetic-stability-program
JAX遺傳質量控制項目:
https://www.jax.org/jax-mice-and-services/find-and-order-jax-mice/why-jax-mice/genetic-quality-control-program
參考文獻
Ivanov II., 2008. Specific microbiota direct the differentiation of IL-17-producing T-helper cells in the mucosa of the small intestine. Cell Hose Microbe. 4(4):337-49. PMID 18854238
Ivanov II., 2009. Induction of intestinal Th17 cells by segmented filamentous bacteria. Cell. 139(3):485-98. PMID 19836068