胰島具有復(fù)雜的異質(zhì)性和亞種群,包含異質(zhì)性細胞、未成熟和成熟的亞群。由于胰島素是血糖的主要調(diào)節(jié)器,大多數(shù)關(guān)于胰島功能障礙的研究都局限于β細胞。然而,越來越多的證據(jù)強調(diào)了α、β和δ細胞在葡萄糖穩(wěn)態(tài)中的協(xié)同相互作用[1-3]。高脂肪飲食(HFD)是導(dǎo)致2型糖尿病的一種常見原因,它會導(dǎo)致胰島的代償性適應(yīng),隨著胰島功能損傷加劇,會使得病人的癥狀加重[4-6]。目前迫切需要α、β和δ細胞亞群的細胞表面標(biāo)志物,以探索肥胖進展和糖尿病發(fā)病過程中各亞群的組成變化,以及高脂飲食誘導(dǎo)胰島代謝的適應(yīng)機制。
南京醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院內(nèi)分泌科楊濤教授團隊在Diabetologia(IF=10.12)上發(fā)表了題為“Single-cell RNA sequencing combined with single-cell proteomics identifies the metabolic adaptation of islet cell subpopulations to high-fat diet in mice”的文章(點擊文末“閱讀原文”查看文獻)。
該研究采用單細胞RNA測序(scRNA-seq)結(jié)合單細胞蛋白質(zhì)組學(xué)分析,深入闡明了各α、β、δ細胞亞群在葡萄糖耐受不良中的功能狀態(tài),為探索胰島內(nèi)分泌亞群在健康和疾病中的命運和功能機制提供了基礎(chǔ)資源。
南京醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院付麒、蔣和敏、錢玙為本文共同第一作者,楊濤、徐寬楓研究員為共同通訊作者,華大科技質(zhì)譜平臺為該研究提供了單細胞蛋白質(zhì)組學(xué)分析服務(wù)。
研究思路及主要成果
圖1 研究流程圖
1、小鼠胰島細胞scRNA-seq
該研究將4周大的雄性小鼠隨機分成兩組,正常喂養(yǎng)(CD)組和高脂肪飲食(HFD)組,喂養(yǎng)8周,每周監(jiān)測體重。8周的HFD誘導(dǎo)小鼠明顯肥胖,葡萄糖穩(wěn)態(tài)受損,并誘導(dǎo)胰島素抵抗,HFD導(dǎo)致胰島團塊代償性增生,尤其是β細胞。研究人員利用高通量scRNA-seq分析了15,093個來自CD小鼠胰島的細胞和18,906個來自HFD喂養(yǎng)小鼠胰島的細胞,并聚成四種主要內(nèi)分泌細胞,基于主要激素基因表達進行了注釋:4,069個α(Gcg)、14,108個β(Ins1)、1,698個δ(Sst)和666個PP(Ppy)細胞。
從HFD組與CD組比較的α、β、δ細胞的差異表達基因(DEGs)來看,α、β、δ細胞內(nèi)質(zhì)網(wǎng)蛋白加工明顯富集,炎癥相關(guān)通路在α細胞中特別豐富(圖2a),這表明炎癥反應(yīng)對HFD誘導(dǎo)的代謝應(yīng)激的重要性。在β細胞中,鈣轉(zhuǎn)運和離子通道調(diào)節(jié)途徑排在首位(圖2b),表明其與分泌功能相關(guān)。此外,在β和δ細胞中,氧化呼吸鏈、能量產(chǎn)生和代謝途徑都顯著富集。在δ細胞中,其他顯著受HFD影響的途徑是蛋白質(zhì)降解和循環(huán)相關(guān)途徑(圖2c)。
圖2 HFD和正常組之間α(a)、β(b)和δ(c)細胞中DEGs富集的KEGG通路前20位
2、胰島細胞亞群的單細胞蛋白質(zhì)組學(xué)分析
由于mRNA的表達不能完全反映細胞或器官的生物活性,全面的蛋白表達譜在胰島細胞亞群研究中是必不可少的。然而,傳統(tǒng)的蛋白質(zhì)組學(xué)需要樣本量高,而小鼠胰腺中胰島細胞數(shù)量有限,流式細胞儀分類的細胞亞群產(chǎn)量低。
因此,該研究對胰島細胞亞群進行了單細胞蛋白質(zhì)組學(xué)分析。首先,研究人員利用大量胰島樣品的譜庫,在數(shù)據(jù)依賴采集模式下進行質(zhì)譜(MS)數(shù)據(jù)采集,鑒定出90,494個多肽和8,168個蛋白質(zhì)。接下來,MaxQuant集成的Andromeda引擎識別了α、β和δ亞群的單細胞蛋白質(zhì)組學(xué)樣本中的蛋白質(zhì)。最終,在36個胰島細胞亞群樣本(2種飼料×3種內(nèi)分泌細胞類型×2種細胞亞群×3個重復(fù))中,研究人員鑒定出6,955個蛋白質(zhì)和50,245個肽。
3、RNA測序技術(shù)結(jié)合單細胞蛋白質(zhì)組學(xué)闡明各細胞亞群在葡萄糖耐受不良中的功能狀態(tài)
ACE2low α細胞可能代表低容量、脆弱和對HFD應(yīng)激易感性的狀態(tài)
為了探索ACE2為基礎(chǔ)的α細胞異質(zhì)性的分子特征,在Ace2low和Ace2high亞群之間鑒定出379個DEGs,KEGG分析顯示,DEGs優(yōu)先富集于氧化磷酸化、代謝途徑、α細胞分泌功能相關(guān)途徑和程序性細胞死亡、增殖途徑,表明Ace2表達可以區(qū)分不同功能和生存狀態(tài)的α細胞。與Ace2high亞群相比,Ace2low亞群與α細胞功能相關(guān)的基因表達下調(diào),與β細胞特征相關(guān)的基因表達上調(diào)。這表明Ace2low亞群可能代表未成熟的α細胞,這些細胞似乎具有β細胞樣特征。單細胞蛋白質(zhì)組學(xué)進一步分析了ACE2low α和ACE2high α細胞HFD組和CD組之間的DEPs和富集KEGG通路。ACE2low α細胞中下調(diào)的DEPs數(shù)量比ACE2high α細胞多,且這些下調(diào)的DEPs富集在更多與代謝相關(guān)的通路中。這表明ACE2low α細胞更容易受到高熱量應(yīng)激的影響,可能是一組低容量、脆弱的α細胞,而ACE2high α細胞可能代表小鼠的主要功能細胞群,它們能夠更好地承受高熱量應(yīng)激。
CD81high β細胞可能代表功能較弱的未成熟β細胞
為了分析β細胞的異質(zhì)性,研究將β細胞聚為9個簇,并鑒定出前10個標(biāo)記基因。研究發(fā)現(xiàn)CD81在β細胞簇中有差異表達,然后將9個β細胞簇分為CD81low和CD81high亞群。CD81low亞群相對于CD81high亞群,DEGs和富集的KEGG通路顯示細胞代謝通路以及一系列應(yīng)激相關(guān)的炎癥通路均顯著富集。關(guān)鍵的β細胞轉(zhuǎn)錄因子Mafa和β細胞成熟標(biāo)記物在CD81low亞群中有高mRNA表達,而未成熟β細胞標(biāo)記物在CD81high亞群中有高表達,這表明CD81high亞群可能代表了一組功能弱且未成熟的β細胞。
為了進一步探索HFD對β細胞亞群的影響,F(xiàn)ACS顯示與CD小鼠相比,HFD小鼠中CD81high β細胞的比例下降。在CD小鼠中檢測到869個上調(diào)和373個下調(diào)的DEPs,在HFD小鼠中檢測到707個上調(diào)和312個下調(diào)的DEPs(圖5a、b)。CD81low亞群中與能量代謝相關(guān)的途徑都被下調(diào)(圖5 c、d)。HFD和CD β細胞的scRNA-seq中,參與這些通路的下調(diào)的DEPs也降低了,結(jié)果反映了轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組的一致性。此外,在CD和HFD小鼠中,與β細胞成熟和功能維持相關(guān)的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子PDX1在CD81low細胞中相對于CD81high細胞顯著上調(diào)(圖5e、f),在CD81low細胞中,內(nèi)吞作用、吞噬體、蛋白酶體和突觸囊泡循環(huán)通路中富集的DEPs大多上調(diào),表明CD81low細胞處于更成熟的狀態(tài)。
HFD增強了成熟GLUT2low δ細胞的功能
盡管Slc2a2(編碼GLUT2)是β細胞的標(biāo)志基因,但研究人員仍然在scRNA-seq中發(fā)現(xiàn)了一小群Slc2a2相對高表達的δ細胞,因此將δ細胞分為Slc2a2low和Slc2a2high亞群。根據(jù)Slc2a2low亞群和Slc2a2high亞群中的DEGs和富集通路,上調(diào)通路與鈣離子和激素分泌有關(guān),提示Slc2a2low亞群可能功能更成熟。來自CD和HFD小鼠的FACS分選GLUT2low和GLUT2high δ細胞亞群(每個樣品3,000個細胞)用于單細胞蛋白質(zhì)組學(xué)分析,KEGG分析顯示,與β細胞相似,在CD小鼠中GLUT2low細胞中,相對于GLUT2high細胞,氧化磷酸化和阿爾茨海默病通路顯著下調(diào)(圖3c)。CD和HFD小鼠GLUT2low細胞中的多種營養(yǎng)代謝途徑也顯著上調(diào)(圖3c,d)。內(nèi)質(zhì)網(wǎng)相關(guān)途徑的內(nèi)吞作用和蛋白質(zhì)加工也是如此,表明GLUT2low亞群的代謝更活躍。在GLUT2low δ細胞中,比較HFD和CD小鼠,代謝相關(guān)通路、鈣信號通路、胰腺分泌、胰島素和胰高血糖素信號通路顯著上調(diào),表明HFD促進了GLUT2low δ細胞的能量代謝。綜上,GLUT2low δ細胞可能比GLUT2high δ細胞更具有功能和代謝活性,HFD進一步刺激GLUT2low δ細胞的功能和代謝。
圖6 δ細胞亞群功能的單細胞蛋白質(zhì)組學(xué)鑒定
總 結(jié)
ACE2、CD81和GLUT2作為表面標(biāo)記物分別區(qū)分成熟度和功能狀態(tài)不同的α、β和δ細胞亞群。在HFD誘導(dǎo)的葡萄糖耐受不良中,低容量和未成熟的ACE2low α細胞比例隨著功能活躍和成熟CD81low β細胞比例的增加而增加。成熟的GLUT2low δ細胞功能增強,但比例不變。這些動態(tài)變化揭示了胰島在HFD應(yīng)激下的代謝可塑性,這種可塑性適應(yīng)可以通過抑制α細胞的高血糖效應(yīng),增強β細胞的低血糖效應(yīng),以及增加δ細胞對α和β細胞的調(diào)節(jié)來抵消代謝應(yīng)激,恢復(fù)葡萄糖穩(wěn)態(tài)。因此,靶向上述標(biāo)志物改變胰島亞群分布,以增強胰島功能可能是治療糖尿病的有效方法。
圖7 小鼠胰島細胞(α、β和δ)亞群在HFD誘導(dǎo)下的胰島功能紊亂
科技君點睛
本研究利用單細胞RNA測序技術(shù)(scRNA-seq)在HFD誘導(dǎo)的葡萄糖耐受小鼠模型中鑒定α、β和δ細胞亞群標(biāo)記物,通過流式細胞儀和免疫染色對各亞群的比例進行分類和評估,并對分選細胞進行單細胞蛋白質(zhì)組學(xué)分析,通過蛋白表達深入闡明各α、β、δ細胞亞群在葡萄糖耐受不良中的功能狀態(tài)。
參考文獻:
[1] Control of insulin secretion by cholinergic signaling in the human pancreatic islet. Diabetes. 2014
[2] Urocortin3 mediates somatostatin-dependent negative feedback control of insulin secretion. Nat Med. 2015
[3] δ-cells and β-cells are electrically coupled and regulate α-cell activity via somatostatin. J Physiol. 2018
[4] Body-mass index and obesity in urban and rural China: findings from consecutive nationally representative surveys during 2004–18. Lancet. 2021
[5] Epidemiology and determinants of obesity in China. Lancet Diabetes Endocrinol. 2021
[6] Ethnicity-specific BMI cutoffs for obesity based on type 2 diabetes risk in England: a population-based cohort study. Lancet Diabetes Endocrinol. 2021