研究背景與技術(shù)挑戰(zhàn)
人腦研究的瓶頸與組織透明化技術(shù)進(jìn)展
人腦研究面臨倫理、法律及樣本獲取的多重限制,而嚙齒動(dòng)物模型難以完全模擬人類(lèi)疾病特征。組織透明化技術(shù)通過(guò)降低組織折射率實(shí)現(xiàn)三維成像,已在動(dòng)物模型中廣泛應(yīng)用(如iDISCO+、FDISCO、MACS)。其中,CLARITY技術(shù)保留蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的同時(shí)去除脂質(zhì),大多數(shù)關(guān)于CLARITY技術(shù)的研究集中在固定的嚙齒動(dòng)物腦組織上,對(duì)于人類(lèi)大腦樣本的研究相對(duì)較少。盡管已有部分研究嘗試將組織透明化技術(shù)應(yīng)用于人類(lèi)大腦,以探究人類(lèi)發(fā)育異常大腦、阿爾茨海默病、路易體病和自閉癥等疾病的發(fā)病機(jī)制,但這些研究樣本缺乏在透明化時(shí)間、偽影以及染色效率等方面的定量比較。此外,在抗體染色方法的選擇和比較上,相關(guān)研究也較為匱乏,而抗體染色通常被認(rèn)為是人類(lèi)腦組織透明化研究的主要瓶頸。
X-CLARITY™技術(shù)的優(yōu)化目標(biāo)
提高組織透明化效率:減少透明化所需時(shí)間,使新鮮樣本達(dá)到80%透明度的平均時(shí)間從4小時(shí)進(jìn)一步縮短,遺體樣本從40小時(shí)大幅減少,同時(shí)提升透明度質(zhì)量,降低樣本腫脹程度和殘留污漬,增強(qiáng)樣本處理效果。
降低樣本處理成本:簡(jiǎn)化操作流程,減少實(shí)驗(yàn)步驟和所需試劑,降低時(shí)間和經(jīng)濟(jì)成本,使研究人員能更高效、低成本地使用該技術(shù)處理大量樣本。
減少偽影干擾:通過(guò)改進(jìn)處理方法,降低因自發(fā)熒光和激光散射產(chǎn)生的偽影,尤其是減少尸體樣本中的偽影數(shù)量和分散度,提高成像清晰度和準(zhǔn)確性,避免偽影對(duì)研究結(jié)果的誤判。
增強(qiáng)抗體染色效果:優(yōu)化染色條件,提高抗體穿透深度,使染色更均勻、穩(wěn)定,實(shí)現(xiàn)更多種類(lèi)蛋白質(zhì)的有效染色。
擴(kuò)大樣本適用性:從目前主要針對(duì)人腦皮層小樣本,拓展到適用于大腦不同區(qū)域、不同類(lèi)型的組織樣本,同時(shí)更好地處理新鮮樣本和尸體樣本,減少樣本差異對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果的影響。
技術(shù)創(chuàng)新與應(yīng)用
樣本的精心選取與處理
新鮮樣本均在死后80小時(shí)內(nèi)收集,暫存于4°C環(huán)境,之后將大腦皮層中央溝周?chē)牟糠纸M織在4%多聚甲醛(PFA)中固定1周,再轉(zhuǎn)移至含0.02%疊氮化鈉的磷酸鹽緩沖鹽水(PBS)溶液中保存。遺體樣本大腦皮層組織塊在4% PFA中固定超過(guò)1年,實(shí)驗(yàn)前同樣浸泡在溶液中。
X-CLARITY™技術(shù)的巧妙運(yùn)用
研究人員選用X-CLARITY™技術(shù)對(duì)組織樣本進(jìn)行透明化處理。首先,將組織塊手工切成約1毫米厚的切片,在水凝膠中孵育1天。對(duì)于新鮮樣本,前期樣本切片較厚,后期樣本則借助1毫米網(wǎng)格精確切成1毫米厚。隨后,使用X-CLARITY™聚合系統(tǒng)進(jìn)行3小時(shí)聚合反應(yīng)。聚合完成后,組織塊用PBS洗滌3小時(shí),再進(jìn)行X-CLARITY™透明化處理,直至樣本達(dá)到理想的透明效果。
多元染色方法的探索與比較
為了找到最佳染色方法,研究團(tuán)隊(duì)對(duì)比了三種染色方案:4天染色法(4DS)、11天染色法(11DS)和使用商業(yè)試劑盒的4天染色法(4DS-C)。在4天染色法方法中,預(yù)處理后的樣本先在含抗膠質(zhì)纖維酸性蛋白(GFAP)抗體的溶液中孵育4天后洗滌2天,再在其他溶液中孵育4天,最后洗滌2天。11天染色法方法與4天染色法步驟相似,只是一抗和二抗的孵育時(shí)間均延長(zhǎng)至11天。商業(yè)試劑4天染色法方法則先在透化緩沖液中浸泡2天,接著在含GFAP抗體的試劑盒染色緩沖液中孵育4天,洗滌后再在試劑盒染色緩沖液中孵育4天,最后洗滌2天。
成像與數(shù)據(jù)分析的科學(xué)流程
成像前,樣本需在封片劑中浸泡4小時(shí),以實(shí)現(xiàn)折射率的均勻化。共聚焦顯微鏡使用405nm、488nm和594nm的激光激發(fā)波長(zhǎng),搭配10倍物鏡和20倍物鏡進(jìn)行圖像采集。利用Zen Blue、LAS X和Imaris軟件對(duì)圖像進(jìn)行可視化和三維渲染處理,以便更直觀地觀察樣本結(jié)構(gòu)。
在數(shù)據(jù)分析環(huán)節(jié),研究人員借助ImageJ軟件進(jìn)行多項(xiàng)指標(biāo)的量化分析。通過(guò)計(jì)算樣本透明前后的不透明度,評(píng)估透明化效率;將樣本中自發(fā)熒光和激光散射產(chǎn)生的偽影與圖像亮度關(guān)聯(lián),量化偽影水平;依據(jù)GFAP抗體熒光亮度估算染色抗原的含量;以DAPI信號(hào)亮度衡量DAPI染色效率。
成像實(shí)驗(yàn)與結(jié)果分析
兩種樣本透明化效率大比拼研究人員利用X-CLARITY™技術(shù)對(duì)兩種樣本進(jìn)行透明化處理,并詳細(xì)
記錄了透明化效率隨時(shí)間的變化。結(jié)果顯示,隨著透明化時(shí)間的增加,兩種樣本的透明化效率(即透明度)均呈非線(xiàn)性上升趨勢(shì)(不透明度下降)。新鮮樣本平均僅需4小時(shí)就能達(dá)到80%的透明度,而遺體樣本則需要40小時(shí),此外,透明化處理后,兩種樣本均出現(xiàn)了腫脹現(xiàn)象,綜合來(lái)看,新鮮樣本在透明化時(shí)間和質(zhì)量方面均優(yōu)于遺體樣本。
兩種樣本偽影差異顯著
偽影會(huì)嚴(yán)重干擾熒光圖像的采集,影響研究結(jié)果的準(zhǔn)確性。研究人員對(duì)比了透明化14小時(shí)的新鮮樣本和遺體樣本的偽影情況,發(fā)現(xiàn)遺體樣本的偽影更為明顯,且分布更為分散。進(jìn)一步通過(guò)ImageJ軟件量化分析發(fā)現(xiàn),新鮮樣本的偽影與不透明度呈一定相關(guān)性,而遺體樣本的相關(guān)性較弱。即使在相似的不透明度范圍內(nèi),遺體樣本的偽影數(shù)量也顯著多于新鮮樣本。這表明新鮮樣本產(chǎn)生的偽影明顯少于遺體樣本,更有利于后續(xù)的成像觀察。
DAPI染色在新鮮樣本中更具優(yōu)勢(shì)
DAPI作為一種能高效穿透組織并對(duì)核酸進(jìn)行染色的納米級(jí)化學(xué)染料,其在不同孵育時(shí)間下的染色深度在人腦樣本中尚未得到精確研究。研究人員對(duì)人類(lèi)大腦皮層進(jìn)行不同時(shí)長(zhǎng)的DAPI染色實(shí)驗(yàn),發(fā)現(xiàn)當(dāng)孵育時(shí)間超過(guò)16小時(shí)時(shí),DNA染色深度可超過(guò)500μm。而且,隨著孵育時(shí)間的延長(zhǎng),不僅染色深度增加,樣本表面的熒光亮度也有所提高。對(duì)比新鮮樣本和遺體樣本的DAPI染色效果,發(fā)現(xiàn)1毫米厚的遺體組織樣本在染色4天后,幾乎沒(méi)有DAPI染色信號(hào)(僅有自發(fā)熒光),即使使用30μm厚的切片也未觀察到染色;而新鮮樣本在3D透明化的30μm切片中則有明顯的DAPI染色。這充分說(shuō)明DAPI在新鮮樣本中的染色效率更高。
GFAP染色在兩種樣本中表現(xiàn)相近
研究人員采用4天染色法方法,使用抗體對(duì)透明化后的新鮮樣本和遺體樣本進(jìn)行染色,以比較二者的GFAP染色效率。結(jié)果顯示,在相同的透明化時(shí)間或相同的透明化效率下,新鮮樣本和遺體樣本的GFAP染色效果相似。這表明在GFAP染色方面,新鮮樣本和遺體樣本的表現(xiàn)相近。
4DS-C染色方法脫穎而出
研究人員對(duì)4DS、11DS和4DS-C三種染色方法進(jìn)行全面比較,評(píng)估指標(biāo)涵蓋染色時(shí)間、抗體穿透深度、方法復(fù)雜度、組織污染程度和成本,結(jié)果表明,4DS-C方法的抗體染色深度最深。在方法復(fù)雜度方面,4DS-C方法借助商業(yè)試劑盒,操作相對(duì)簡(jiǎn)便,組織污染程度較低,染色后產(chǎn)生的可見(jiàn)偽影較少。因此,4DS-C方法在三種染色方法中表現(xiàn)最為出色。
3D成像呈現(xiàn)大腦微觀結(jié)構(gòu)之美
借助優(yōu)化后的組織透明化技術(shù)和4天染色方法,研究人員成功獲取了人類(lèi)大腦的3D圖像。使用凝集素作為染色染料,能夠清晰呈現(xiàn)血管及其復(fù)雜的分支結(jié)構(gòu)。利用抗GFAP抗體,則可觀察到結(jié)構(gòu)極為復(fù)雜的人類(lèi)大腦星形膠質(zhì)細(xì)胞。通過(guò)組合GFAP染色(顯示星形膠質(zhì)細(xì)胞)、DAPI染色(顯示細(xì)胞核)和凝集素染色(顯示血管),還構(gòu)建出了人類(lèi)大腦的復(fù)合圖像。
總結(jié)與展望
該研究?jī)?yōu)化的腦組織透明化和成像方法,是腦科學(xué)研究的有力技術(shù)支撐。用新鮮樣本和4DS-C染色法,能清晰觀察大腦三維微觀結(jié)構(gòu),助力了解大腦正常發(fā)育和疾病時(shí)的結(jié)構(gòu)變化,為揭示大腦奧秘打基礎(chǔ),像研究阿爾茨海默病時(shí)可助于探索發(fā)病機(jī)制。此技術(shù)在腦部疾病診療上潛力巨大,可幫助醫(yī)生精準(zhǔn)識(shí)別病變組織微觀特征,提升早期診斷率。治療方面,依據(jù)大腦結(jié)構(gòu)變化設(shè)計(jì)針對(duì)性方案,如針對(duì)帕金森病開(kāi)發(fā)神經(jīng)修復(fù)療法。但未來(lái)還需優(yōu)化染色方案、擴(kuò)大樣本范圍、增加樣本量、改進(jìn)成像技術(shù),有望開(kāi)發(fā)更優(yōu)透明化技術(shù)和染色方法,結(jié)合單細(xì)胞測(cè)序等技術(shù),從多層面解析大腦奧秘,推動(dòng)腦科學(xué)發(fā)展。
論文信息
聲明:本文僅用作學(xué)術(shù)目的。
Kim MS, Ahn JH, Mo JE, Song HY, Cheon D, Yoo SH, Choi HJ. Optimizing tissue clearing and imaging methods for human brain tissue. J Int Med Res. 2021 Mar;49(3):3000605211001729.
DOI:10.1177/03000605211001729.