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焦磷酸測序技術原理及應用

瀏覽次數(shù):14258 發(fā)布日期:2018-11-20  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責任自負
焦磷酸測序(Pyrosequencing)技術
 
焦磷酸測序技術(pyrosequencing)是由Nyren等人于1987年發(fā)展起來的一種新型的酶聯(lián)級聯(lián)測序技術,焦磷酸測序法適于對已知的短序列的測序分析,其可重復性和精確性能與SangerDNA測序法相媲美,而速度卻大大的提高。焦磷酸測序技術產(chǎn)品具備同時對大量樣品進行測序分析的能力,為大通量、低成本、適時、快速、直觀地進行DNA甲基化、SNP等單個/連續(xù)多個核苷酸變異進行實時定量檢測提供了非常理想的技術操作平臺。

 一. 焦磷酸測序技術原理
       焦磷酸測序技術是由4種酶催化的同一反應體系中的酶級聯(lián)化學發(fā)光反應。焦磷酸測序技術的原理是:引物與模板DNA退火后,在DNA聚合酶(DNA polymerase)、ATP硫酸化酶(ATP sulfurytase).熒光素酶(1uciferase)和三磷酸腺苷雙磷酸酶(Apyrase)4種酶的協(xié)同作用下,將引物上每一個dNTP的聚合與一次熒光信號的釋放偶聯(lián)起來,通過檢測熒光的釋放和強度,達到實時測定DNA序列的目的。焦磷酸測序技術的反應體系由反應底物、待測單鏈、測序引物和4種酶構成。反應底物為5’-磷酰硫酸(adenosine- 5’-phosphosulfat,APS)、熒光素(1uciferin)。
 
 
1.每次加入一個dNTP, 在聚合酶作用下產(chǎn)生一個焦磷酸(PPi);
          

 
 2. 硫酸化酶轉(zhuǎn)化PPi為ATP,ATP使熒光素酶發(fā)出熒光(產(chǎn)生的光強度與結合的核苷數(shù)量成正比). 
3. 多余的dNTP被降解,開始新一個循環(huán).
 
 
 4. 測序結果
 
 
 
 
 
 
  • 技術平臺:
QIAGEN公司PyroMark Q24,PyroMark Q48 Autoprep,PyroMark Q96 ID焦磷酸測序儀
 
 
 
 焦磷酸測序?qū)嶒灹鞒?nbsp;
 
  
 焦磷酸測序技術應用
  • DNA甲基化檢測
 
 全基因組甲基化水平檢測:LUMA法 
 
  
  • SNP定量檢測/等位基因差異表達檢測
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來源:上海希匹吉生物技術有限公司
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