Naica數(shù)字PCR技術檢測IDH2突變
瀏覽次數(shù):2216 發(fā)布日期:2019-12-20
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IDH2基因所編碼的蛋白名為異檸檬酸脫氫酶2,人類IDH有三種類型,分別為IDH1、IDH2和IDH3,IDH1定位于細胞質和過氧化物酶體中,IDH2和IDH3定位于線粒體中。該類蛋白酶可以將異檸檬酸氧化為草酰琥珀酸,然后再轉化為α-酮戊二酸。其中,IDH1/2是人類癌癥中代謝基因發(fā)生突變頻率最高的,并干擾細胞新陳代謝和表觀遺傳調控,從而促進腫瘤發(fā)生。在急性髓白血病中,IDH1/2突變與正常的核型,年齡及NPM1的突變有關,其中IDH2 R140Q突變最為常見。
近日,法國著名大學-巴黎薩克雷大學Gustave Roussy血液學系、生物與醫(yī)學病理學系以及轉化研究實驗室等聯(lián)合在德國Annals of Hematology上發(fā)表了一篇名為Spontaneous molecular response of IDH2 acute myeloid leukemia的文章。
研究報告了一例IDH2突變的急性髓細胞白血病(AML)患者,檢測發(fā)現(xiàn)有61%的骨髓原始細胞。細胞遺傳學揭示了其復雜的核型,二代測序分析顯示IDH2 R140Q(突變頻率28%)和KRASK117N(突變頻率22%)突變。隨后,研究人員再次對患者進行了骨髓抽吸,發(fā)現(xiàn)骨髓原始細胞從61%下降到17%,其中存在許多組織細胞和紅細胞吞噬。進一步的細胞遺傳學研究和NGS分析顯示復雜的核型消失,但IDH2 R140Q突變減少(5%),BRAF突變持續(xù)存在(31%),表明克隆進化。
鑒于患者的身體狀況不佳以及兩次骨髓抽吸結果不一致,研究人員決定進行第三次骨髓抽吸。出乎意料的是,骨髓原始細胞小于5%,并伴隨許多細胞吞噬。為了進一步驗證該結果,研究人員通過使用法國Stilla Technologies的Naica 微滴芯片式數(shù)字PCR系統(tǒng),對3個時間點的IDH2 R140Q突變進行了定量。結果如下圖所示,和骨髓原始細胞的變化趨勢一致,IDH2突變從28.15%急劇下降到2.32%。
急性髓白血。ˋML)以不成熟髓細胞在骨髓里聚集,以及骨髓造血抑制為特征。AML的自發(fā)性完全緩解(SCR)是極其罕見的一種現(xiàn)象,目前關于其發(fā)生機制仍有待探討。上述研究揭示了SCR與IDH2 R140Q的關系,并且IDH突變的評估可以通過數(shù)字PCR量化并與總生存期相關聯(lián)。希望這一發(fā)現(xiàn)可以為急性髓白血病的治療提供一個靶點和方向。
法國巴黎薩克雷大學(Université Paris-Saclay)合并了3所大學、4所大學校(Grande Ecole)與7個研究所,包括巴黎第十一大學、凡爾賽大學、中央理工-高等電力學院(CentraleSupélec)、高等光學學院、法國國家原子能研究所(CEA)、法國國家科學研究院(CNRS)等。在2019 US News世界大學排名中,位列全球第30名,歐洲大陸第2名,法國第1名。
Annals of Hematology:《血液學年鑒》,IF=2.85。涵蓋了臨床和實驗血液學、止血學、輸血以及腫瘤醫(yī)學的相關領域,包括白血病、淋巴腫瘤和實體腫瘤的診斷和治療,以及造血干細胞的移植。內容包括與人類血液病相關的腫瘤學、分子生物學和免疫學等方面。該雜志與德國血液學和醫(yī)學腫瘤學協(xié)會,以及奧地利血液學和腫瘤學協(xié)會有聯(lián)系。主編:阿諾德·甘瑟,德國漢諾威大學血液、止血和腫瘤學系。
該項研究使用了來自法國Stilla Technologies的Naica微滴芯片式數(shù)字PCR系統(tǒng)。
該系統(tǒng)利用cutting-edge微流體創(chuàng)新型芯片—Sapphire芯片作為數(shù)字PCR過程的唯一耗材。樣品通過毛細通道網格以30,000個微滴的形式進入2D芯片中。并且還是首款3色熒光檢測儀器,整個流程只需要兩個半小時。結合強大的圖像分析技術和直觀可視的檢測功能,從而達到了數(shù)字PCR定量卓越的置信水平,獲得的數(shù)據真實可信。
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