新年首篇Nature Chemical Biology,祝賀浙江大學(xué)王寶俊團(tuán)隊在Nature Chemical Biology上發(fā)表題為“Programmable trans-splicing riboregulators for complex cellular logic computation”的研究文章。
研究團(tuán)隊開發(fā)了一類基于斷裂內(nèi)含子反式剪接的基因調(diào)控技術(shù)(SENTRs),SENTR庫提供低泄漏表達(dá)、寬動態(tài)范圍、高機(jī)器學(xué)習(xí)可預(yù)測性以及多組分水平的低串?dāng)_。SENTR技術(shù)具有優(yōu)越的可編程性、可預(yù)測性、正交性、靈活性,可用于RNA檢測、RNA邏輯計算以及斷裂生物分子的多輸入復(fù)雜邏輯計算。
正交性是衡量基因元件質(zhì)量的一項重要指標(biāo),它指多個元件同時使用時,相互之間互不干擾的能力。在正交 SENTR 的設(shè)計和評估過程中,研究團(tuán)隊采用BMG的FLUOstar Omega讀取熒光,計算熒光比值獲得串?dāng)_水平。
研究團(tuán)隊也對RNA反式剪接系統(tǒng)的靈活性、穩(wěn)健性以及應(yīng)用進(jìn)行了進(jìn)一步的探索。通過下游報告基因檢測,評估其調(diào)控功能。研究團(tuán)隊采用BMG的FLUOstar Omega分別讀取綠色熒光、紅色熒光、藍(lán)色熒光和OD600, 使用Omega MARS 3.32 software數(shù)據(jù)分析軟件進(jìn)行熒光/OD600標(biāo)準(zhǔn)化處理,以檢測報告基因。
穩(wěn)定,堅固耐用是德國BMG的FLUOstar Omega多功能酶標(biāo)儀的特點優(yōu)勢,不僅僅在生物合成領(lǐng)域,在基因組學(xué),神經(jīng)退行性疾病診斷,微生物生長監(jiān)測等領(lǐng)域都已經(jīng)得到廣泛的應(yīng)用和用戶認(rèn)可。
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